急诊科创建于1984年12月，2011年1月更名为急诊医学部，目前已建成功能齐全、设备先进、配套完善、中医特色浓厚的标准化急救医疗中心，形成以急性胸痛、卒中、创伤、消化道出血、中毒、动物咬蜇伤为救治单元的急诊急救体系，是集临床、教学、科研三位一体的福建省中西医结合重点专科，2023年成为国家中医优势专科建设单位。2006年至今连续15年被评为“全国青年文明号”。现为中国医学救援协会蚂蚁蜇伤专委会副主任委员单位、福建省中医药学会急诊分会副主任委员单位、泉州市中医药学会急诊分会主任委员单位、中国医学救援协会动物伤害救治分会常务理事单位、中华急诊医学教育学院区域动物致伤规范化救治培训基地、岭南中医急诊联盟单位、福建省卫健委蛇伤二级工作室在建单位。晋江市“第一目击者”急救志愿服务队培训基地。 

科室共有医护人员132人，其中医生52人，主任医师1人，副主任医师2人，中级职称19人，住院医师30人，硕士研究生16人；其中护士80人，副主任护师1人，主管护师15人，护师28人，护士36人。配有急诊检验科、急诊CT、急诊MRI，拥有便携式转运呼吸机、体外自动心肺复苏机、除颤仪、自动洗胃机；床边血气分析仪、骨髓穿刺输液系统等各类现代化诊疗设备，能常规开展各类穿刺术、心肺复苏术、电复律及电除颤术、气管插管术、呼吸机使用术、急性心肌梗死PCI治疗术、人工心脏起搏术、骨髓腔穿刺术、洗胃术、急性脑梗塞及急性肺栓塞患者静脉溶栓治疗、各类创伤救治、各种动物咬蜇伤救治等项目。

中医特色诊疗 急诊内科门诊形成以石淋、腹痛为主的中医优势病种；急诊外科门诊形成以犬伤、红火蚁咬伤为主的中医优势病种；急诊抢救室形成以眩晕、胸痹为主的中医优势病种；急诊留观病区（EICU）形成以腹痛（急性胰腺炎）、中风（脑卒中）、蛇咬伤（竹叶青）为主的中医优势病种，开展“郭氏六联疗法”治疗急性胰腺炎，急诊针灸治疗急症、痛症，“针、罐、药三位八法”治疗蛇伤，“退热散”敷脐治疗小儿发热，紫草油、烧伤膏外敷治疗烧烫伤等中医医疗技术项目。